Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms