Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms