Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms