Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp54Q8BL06 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp54Q8BL06 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms