Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2q1Q7TSS2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2q1Q7TSS2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms