Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms