Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1bQ7TSF1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms