Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms