Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm8091-201ENSMUST00000150506 886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VcanQ62059 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VcanQ62059 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms