Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BcanQ61361 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BcanQ61361 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BcanQ61361 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BcanQ61361 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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