Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctnna2Q61301 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ctnna2Q61301 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctnna2Q61301 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms