Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Bhlha9Q5RJB0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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