Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms