Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Puf60Q3UEB3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Puf60Q3UEB3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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