Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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