Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Samd11Q1RNF8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Samd11Q1RNF8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Samd11Q1RNF8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Samd11Q1RNF8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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