Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms