Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms