Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms