Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GscQ02591 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GscQ02591 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GscQ02591 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms