Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nhlh1Q02576 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlh1Q02576 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms