Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms