Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Piwil4-201ENSMUST00000076946 2637 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Stk36-202ENSMUST00000087186 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cbx1P83917 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms