Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms