Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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