Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2iP60898 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms