Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Dpf3P58269 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Dpf3P58269 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dpf3P58269 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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