Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AgrpP56473 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms