Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp1P55194 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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