Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms