Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms