Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxa10P31310 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms