Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pde6aP27664 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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