Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxd8P23463 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms