Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18528 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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P18528 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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P18528 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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P18528 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P18528 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P18528 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms