Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms