Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm4340L7N2C4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms