Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
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Gm20795J3QP49 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm20795J3QP49 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms