Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21976J3QNN2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms