Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms