Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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