Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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