Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac5Q9Z2V6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac5Q9Z2V6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac5Q9Z2V6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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