Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms