Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Upk3aQ9JKX8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Upk3aQ9JKX8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms