Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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OtofQ9ESF1 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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