Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pop5Q9DB28 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms