Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp1b4Q99ME6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms