Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms