Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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